Ústav biologie a chorob volně žijících zvířat byl do současné podoby konstituován v září roku 2000. Jeho pracoviště jsou nyní umístěny v budovách č. 31 a 22. Ústav zajišťuje výuku povinných (např. biologie, biofyzika, zoologie) a povinně volitelných (např. ornitologie, nemoci volně žijících zvířat, molekulární biologie v hygieně potravin) předmětů pregraduálního studia pro obě fakulty.
Akademičtí pracovníci, studenti, projektoví vědečtí pracovníci, technici a laborantky jsou soustředěni k zajištění výzkumu do několika pracovišť: